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Svelare il mistero
di TDP-43, una proteina versatile coinvolta in diversi disturbi
neurodegenerativi
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Di Mirella Vivoli
Sostenuto da Mirella
Vivoli Vega, Fabrizio Chiti, Irene, Dario Diotallevi, Kevin Baldwin, Luca
Aresu, Martina Mancini, Michele Longari, Donato Rose Mary, Simone Forcella e
altri 75 sostenitori
Informazioni su
questo progetto
La proteina TDP-43 è
coinvolta nella sclerosi laterale amyotrofica (ALS) e nella demenza
frontotemporale (FTLD). Inoltre, la patologia TDP-43 è stata associata a
malattie di Alzheimer e Parkinson (Neuman M, Int J Mol Sci, 2009). È sempre più
necessario indagare sulle funzioni normali e patologiche di questa proteina, la
cui purificazione è difficile da raggiungere, poiché nessuno è ancora riuscito,
ma i miei risultati preliminari indicano che è veramente possibile.
Chiedete agli
scienziati
CONNESSE LA DISCUSSIONE
Qual è il contesto
di questa ricerca?
La questione
fondamentale che sto cercando di rispondere è il ruolo del TDP-43 e come e
perché questa proteina è coinvolta in molti disturbi neurodegenerativi, che
tutti presentano accumulazioni di TDP-43 misfolded. Finora, diversi tentativi
di purificazione della proteina a piena lunghezza sono falliti a livello
mondiale a causa delle sue proprietà biochimiche e della sua prontezza
all'aggregazione. Per ottenere la sua struttura tridimensionale, di vitale importanza
per studiare il suo processo di aggregazione, la sua relazione
struttura-funzione e il ruolo delle mutazioni patologicamente rilevanti, dovrei
ottenere una pura proteina. I miei risultati preliminari suggeriscono che
questo è veramente raggiungibile. Per fare questo, avrei bisogno di utilizzare
estensivamente lo strumento FPLC, uno strumento che renderà il processo più
semplice e veloce.
Qual è il
significato di questo progetto?
Le malattie
neurodegenerative rappresentano un enorme carico di malattia, in termini di
sofferenza umana e costi economici. Queste malattie hanno toccato molte delle
nostre vite: i cambiamenti nel comportamento e nella personalità dei nostri
cari sono la parte più impegnativa e disturbata di queste malattie. Dato il
ruolo centrale di TDP-43 in questi disturbi (Cook C et al, Expert Opin Biol
Ther 2008, Buratti E, Adv Genet 2009). E la difficoltà di purificazione di
questa proteina, le nostre opportunità per progredire nella comprensione di
queste malattie sono attualmente limitate dalla disponibilità di una proteina
pura che apre un numero impressionante di studi sulla patobiologia di questa
proteina e sulle opportunità di progettare strategie terapeutiche razionali
Contro le sue malattie associate.
Quali sono gli
obiettivi del progetto?
L'obiettivo finale
di questo progetto è quello di purificare il full-length TDP-43 nella sua forma
nativa. Sarà prima prodotta nei batteri E. coli, poi sottoposti a diverse
strategie di purificazione, che richiedono non solo una persona molto qualificata
nella chimica proteica, ma anche un ampio utilizzo dello strumento FPLC.
Continuerò quindi ad ottimizzare il rapporto resa / costo della procedura di
purificazione con l'aiuto dell'apparecchiatura FPLC e ottenere la struttura
tridimensionale di TDP-43 a tutta lunghezza.
Sono molto fiducioso
nel successo di questa sfida impegnativa; Per questo motivo concentrerò i
nostri studi anche sulle altre forme (mutanti patologici) del TDP-43, che ci
aiuteranno a chiarire il suo ruolo vitale nella cellula.
bilancio
Strumento FPLC $
10.000
L'obiettivo finale
di questo progetto è quello di purificare il full-length TDP-43 nella sua forma
nativa. Ciò richiederà non solo una persona molto qualificata nella chimica
delle proteine, ma anche un ampio uso del FPLC (Fast Protein Liquid
Chromatography) strumento, fondamentale per lo svolgimento del progetto di
ricerca.
Tutte le altre spese
relative alla ricerca saranno coperte dal laboratorio del Prof. Fabrizio Chiti
presso l'Università di Firenze, Firenze.
Unraveling the
mystery of TDP-43, a versatile protein involved in several Neurodegenerative
disorders
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Backed by Mirella
Vivoli Vega, Fabrizio Chiti, Irene, Dario
Diotallevi, Kevin Baldwin, Luca Aresu, Martina Mancini, Michele Longari, Donato Rose Mary, Simone Forcella, and
75 other backers
About This Project
The TDP-43 protein
is involved in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and in frontotemporal
dementia (FTLD). Furthermore, TDP-43 pathology has been associated with
Alzheimer's and Parkinson’s diseases (Neuman M, Int J Mol Sci, 2009). It
is becoming increasingly necessary to investigate the normal and pathological
functions of this protein, whose purification is difficult to achieve as none
has succeeded yet, but my preliminary results indicate that this is indeed
possible.
Ask the Scientists
What is the context
of this research?
The fundamental
question I am trying to answer is what is the role of TDP-43, and how and why
this protein is involved in several neurodegenerative disorders, which all
display accumulations of misfolded TDP-43. So far, several attempts to purify
the full-length protein have failed worldwide due to its biochemical properties
and to its proneness to aggregation. In order to obtain its three-dimensional
structure, which is of vital importance for studying its aggregation process,
its structure-function relationship and the role of the pathologically relevant
mutations, I should obtain a pure protein. My preliminary results suggest that
this is indeed achievable. To do so, I would need to extensively use the
instrument FPLC, a tool that will make the process easier and faster.
What is the
significance of this project?
Neurodegenerative
diseases represent an enormous disease burden, in terms of human suffering and
economic cost. These diseases have touched many of our lives: changes in
behavior and personality of our loved ones are the most challenging and
distressing part of these diseases. Given the central role played by TDP-43 in
these disorders (Cook C et al,Expert Opin Biol Ther. 2008; Buratti
E, Adv Genet. 2009). and the difficulty in purifying this protein,
our opportunities to progress on the understanding of these diseases are
currently limited by the availability of a pure protein, which would opens an
impressive number of studies on the pathobiology of this protein and
opportunities to design rationally therapeutic strategies against its
associated diseases.
What are the goals
of the project?
The ultimate goal of
this project is to purify the full-length TDP-43 to its native form. It will be
first produced in the E. coli bacteria, then subjected to different
possible strategies of purification, which will require not only a very skilled
person in protein chemistry, but also an extensive use of the FPLC instrument.
I will then continue to optimize the yield-to-cost ratio of the purification
procedure, with the help of the FPLC equipment, and will obtain the
tridimensional structure of full-length TDP-43.
I am very confident
in the success of this challenging endeavor; for this reason I will focus our
studies also on the other forms (pathological mutants) of TDP-43, which will
help us to elucidate its vital role in the cell.
Budget
FPLC instrument
$10,000
The ultimate goal of
this project is to purify the full-length TDP-43 to its native form. This will
require not only a very skilled person in protein chemistry, but also an
extensive use of the FPLC (Fast Protein Liquid Chromatography) instrument,
which is vital for conducting the research project.
All other
research-related expenses will be covered by Prof. Fabrizio Chiti's laboratory,
at the University of Florence, Florence, Italy.
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